MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 plasmid pUMN179

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015461	AAC	2	6	68	73	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290581
2	NC_015461	TA	3	6	229	234	50 %	50 %	0 %	0 %	332290581
3	NC_015461	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	332290581
4	NC_015461	TGA	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290581
5	NC_015461	GT	3	6	552	557	0 %	50 %	50 %	0 %	332290581
6	NC_015461	TAAG	2	8	560	567	50 %	25 %	25 %	0 %	332290581
7	NC_015461	TTG	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290581
8	NC_015461	GTAA	2	8	682	689	50 %	25 %	25 %	0 %	332290581
9	NC_015461	AAAT	2	8	720	727	75 %	25 %	0 %	0 %	332290581
10	NC_015461	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	332290581
11	NC_015461	A	7	7	915	921	100 %	0 %	0 %	0 %	332290581
12	NC_015461	TGA	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290581
13	NC_015461	TTAA	2	8	961	968	50 %	50 %	0 %	0 %	332290581
14	NC_015461	AGTT	2	8	974	981	25 %	50 %	25 %	0 %	332290581
15	NC_015461	T	6	6	1033	1038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015461	TGA	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015461	T	6	6	1084	1089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015461	A	7	7	1094	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015461	AAC	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015461	A	6	6	1213	1218	100 %	0 %	0 %	0 %	332290582
21	NC_015461	TCT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290582
22	NC_015461	AAG	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290582
23	NC_015461	ATG	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290582
24	NC_015461	TAA	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290582
25	NC_015461	ATT	2	6	1381	1386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290582
26	NC_015461	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290582
27	NC_015461	GCAA	2	8	1473	1480	50 %	0 %	25 %	25 %	332290582
28	NC_015461	A	6	6	1498	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	332290582
29	NC_015461	TCA	2	6	1541	1546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290582
30	NC_015461	AGA	3	9	1551	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290582
31	NC_015461	ATTT	2	8	1636	1643	25 %	75 %	0 %	0 %	332290582
32	NC_015461	T	6	6	1641	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	332290582
33	NC_015461	ATTAG	2	10	1703	1712	40 %	40 %	20 %	0 %	332290582
34	NC_015461	TCT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015461	AGT	2	6	1792	1797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015461	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015461	TGA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015461	AGAT	2	8	1926	1933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015461	TC	3	6	1937	1942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015461	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015461	GAT	2	6	2062	2067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015461	A	6	6	2079	2084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015461	TAA	2	6	2097	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015461	ACC	2	6	2122	2127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015461	TCTT	2	8	2137	2144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015461	GAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015461	T	6	6	2203	2208	0 %	100 %	0 %	0 %	332290583
48	NC_015461	ATTCT	2	10	2209	2218	20 %	60 %	0 %	20 %	332290583
49	NC_015461	GCT	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290583
50	NC_015461	CCT	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290583
51	NC_015461	T	6	6	2247	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	332290583
52	NC_015461	T	6	6	2255	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	332290583
53	NC_015461	GCT	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290583
54	NC_015461	CAT	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
55	NC_015461	AAG	2	6	2329	2334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290583
56	NC_015461	TG	3	6	2423	2428	0 %	50 %	50 %	0 %	332290583
57	NC_015461	CCA	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290583
58	NC_015461	TCA	2	6	2525	2530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
59	NC_015461	GTT	3	9	2668	2676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
60	NC_015461	A	8	8	2723	2730	100 %	0 %	0 %	0 %	332290583
61	NC_015461	AAT	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290583
62	NC_015461	ACT	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
63	NC_015461	T	6	6	2786	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	332290583
64	NC_015461	GTA	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290583
65	NC_015461	CATT	2	8	2968	2975	25 %	50 %	0 %	25 %	332290583
66	NC_015461	T	7	7	3167	3173	0 %	100 %	0 %	0 %	332290583
67	NC_015461	AACAT	2	10	3183	3192	60 %	20 %	0 %	20 %	332290583
68	NC_015461	A	6	6	3198	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	332290583
69	NC_015461	CTT	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290583
70	NC_015461	TAA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290583
71	NC_015461	TTA	2	6	3247	3252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290583
72	NC_015461	GCT	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290583
73	NC_015461	ACA	2	6	3328	3333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290583
74	NC_015461	CCA	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290583
75	NC_015461	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
76	NC_015461	TCA	2	6	3454	3459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290583
77	NC_015461	TGT	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
78	NC_015461	TAAA	2	8	3503	3510	75 %	25 %	0 %	0 %	332290583
79	NC_015461	AAC	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290583
80	NC_015461	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290583
81	NC_015461	TTA	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290583
82	NC_015461	AAAC	2	8	3642	3649	75 %	0 %	0 %	25 %	332290583
83	NC_015461	AAG	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290583
84	NC_015461	TTG	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290583
85	NC_015461	AACC	2	8	3688	3695	50 %	0 %	0 %	50 %	332290583
86	NC_015461	TAA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290584
87	NC_015461	A	6	6	3808	3813	100 %	0 %	0 %	0 %	332290584
88	NC_015461	TGT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290584
89	NC_015461	AAT	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290584
90	NC_015461	ATT	2	6	3931	3936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290584
91	NC_015461	A	6	6	3968	3973	100 %	0 %	0 %	0 %	332290584
92	NC_015461	TAA	2	6	3988	3993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290584
93	NC_015461	A	7	7	4029	4035	100 %	0 %	0 %	0 %	332290584
94	NC_015461	AAC	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290584
95	NC_015461	A	8	8	4171	4178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015461	TCTA	2	8	4198	4205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015461	TAA	2	6	4206	4211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015461	ATTC	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	332290585
99	NC_015461	ATC	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290585
100	NC_015461	T	6	6	4496	4501	0 %	100 %	0 %	0 %	332290585
101	NC_015461	GCTC	2	8	4516	4523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015461	CAG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015461	T	7	7	4640	4646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015461	TCA	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015461	A	6	6	4686	4691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015461	TAA	2	6	4692	4697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015461	A	6	6	4704	4709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015461	T	6	6	4738	4743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015461	TCT	2	6	4780	4785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290586
110	NC_015461	ACT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290586
111	NC_015461	CCG	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332290586
112	NC_015461	GCT	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290586
113	NC_015461	T	6	6	5009	5014	0 %	100 %	0 %	0 %	332290586
114	NC_015461	AAT	2	6	5071	5076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290586
115	NC_015461	GAT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290586
116	NC_015461	GTT	2	6	5092	5097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290586
117	NC_015461	CT	3	6	5112	5117	0 %	50 %	0 %	50 %	332290586
118	NC_015461	GCC	2	6	5118	5123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332290586
119	NC_015461	T	6	6	5150	5155	0 %	100 %	0 %	0 %	332290586
120	NC_015461	CTT	2	6	5192	5197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290586
121	NC_015461	TTG	2	6	5217	5222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290586
122	NC_015461	TCGT	2	8	5248	5255	0 %	50 %	25 %	25 %	332290586
123	NC_015461	AG	3	6	5277	5282	50 %	0 %	50 %	0 %	332290586
124	NC_015461	TACGA	2	10	5355	5364	40 %	20 %	20 %	20 %	332290586
125	NC_015461	GA	3	6	5428	5433	50 %	0 %	50 %	0 %	332290586
126	NC_015461	TGC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290586
127	NC_015461	TGA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015461	AATT	2	8	5649	5656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015461	TTAG	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015461	TAA	3	9	5697	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015461	ATT	2	6	5754	5759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015461	AT	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015461	AG	3	6	5816	5821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015461	ATTAC	2	10	5829	5838	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015461	GAC	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015461	CAA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015461	TAG	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015461	AAT	2	6	6212	6217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015461	A	6	6	6236	6241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015461	T	6	6	6248	6253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015461	TTA	2	6	6292	6297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015461	CGAA	2	8	6322	6329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015461	A	6	6	6417	6422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015461	AT	3	6	6433	6438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015461	T	6	6	6479	6484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015461	A	6	6	6509	6514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015461	A	7	7	6526	6532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015461	TTCT	2	8	6558	6565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015461	TCTT	4	16	6566	6581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015461	GTA	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015461	GTA	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015461	GTA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015461	GTA	2	6	6699	6704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015461	TA	3	6	6713	6718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015461	TAT	2	6	6723	6728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015461	TAA	2	6	6750	6755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015461	ATTA	2	8	6759	6766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015461	ATC	2	6	6774	6779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.